หลังจากที่ผ่านเรื่องที่น่าสยดสยองได้สร้างความหายนะให้กับประชาชนทั่วไป รัฐบาลต่างๆ ของโลกก็หันไปใช้มาตรการ เพื่อสานต่อวาระของพวกเขา นั่นคือสงครามที่ต่อสู้กันในเงามืด ลิลี่ สาวสวยผมขาว เป็นนักเรียนในสถาบันแห่งหนึ่งที่ฝึกฝนเยาวชนให้เป็นสายลับที่มีความสามารถ น่าเสียดายที่แม้จะทำคะแนนได้ดีในการสอบข้อเขียน แต่เธอก็ทำได้เพียงผ่านภาคปฏิบัติไปเท่านั้น เมื่อไม่มีทักษะในโลกแห่งความเป็นจริงให้พูดถึง ความหวังที่จะสำเร็จการศึกษาของเธอจึงน่าหดหู่ใจ จนกระทั่งเธอได้รับโอกาสให้เข้าร่วมทีมลึกลับ โทโมชิบิ และเข้าร่วมในภารกิจที่ไม่สามารถผ่านได้